Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms