Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CRISPLD2-201ENST00000262424 4586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AC027682.7-201ENST00000623147 2121 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TMC3-201ENST00000359440 4641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PCDHGC3-202ENST00000611950 2849 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PCDHGA1-201ENST00000378105 4069 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HSBP1L1C9JCN9 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms