Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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