Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP35Q9P2H5 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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USP35Q9P2H5 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP35Q9P2H5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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