Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms