Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK1EP49674 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms