Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPB2P35606 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms