Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms