Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM220BPB1ANY3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms