Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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