Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL359649.1-201ENST00000607406 1741 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms