Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q6P435 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6P435 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6P435 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6P435 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q6P435 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6P435 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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