Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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