Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms