Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms