Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FDFT1P37268 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms