Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CREB3O43889 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CREB3O43889 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CREB3O43889 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CREB3O43889 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CREB3O43889 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CREB3O43889 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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