Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP20Q9Y6A4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP20Q9Y6A4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms