Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB2Q9Y5E7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms