Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MKLN1Q9UL63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MKLN1Q9UL63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms