Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN3Q9UKA8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms