Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPR1Q9UBH6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPR1Q9UBH6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms