Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms