Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LARSQ9P2J5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARSQ9P2J5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms