Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDE1Q9NXR1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 585.8 ms