Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT57Q9NWB7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms