Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF19AQ9NV58 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF19AQ9NV58 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF19AQ9NV58 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms