Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCF3Q9NUQ8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms