Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC4Q9NTJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms