Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC2Q9NRP2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMC2Q9NRP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms