Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF3Q9NR23 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms