Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.536e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.56e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CC2D1A-206ENST00000589138 2435 ntTSL 518.06■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PFKFB2-204ENST00000464777 523 ntTSL 317.84■□□□□ 0.456e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.446e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-221ENST00000569813 579 ntTSL 217.73■□□□□ 0.436e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.426e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-210ENST00000484316 933 ntTSL 317.65■□□□□ 0.426e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 NSMF-202ENST00000371468 672 ntTSL 217.65■□□□□ 0.426e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.46e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 TMCO3-203ENST00000460039 864 ntTSL 317.4■□□□□ 0.386e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HIRIP3-202ENST00000563053 1686 ntTSL 217.28■□□□□ 0.366e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MINK1-208ENST00000572629 827 ntTSL 317.26■□□□□ 0.357e-40■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC9-207ENST00000506458 818 ntTSL 217.25■□□□□ 0.356e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-208ENST00000447223 915 ntTSL 317.13■□□□□ 0.336e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.336e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.326e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 GABPA-203ENST00000487266 780 ntTSL 216.97■□□□□ 0.316e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MLKL-205ENST00000573267 1004 ntTSL 516.89■□□□□ 0.296e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.296e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.286e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.286e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.286e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.266e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.265e-16■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CACNA1E-208ENST00000533229 2142 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.256e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.256e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-202ENST00000417043 816 ntTSL 316.57■□□□□ 0.246e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZBTB44-203ENST00000445008 3848 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.236e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-210ENST00000478257 880 ntTSL 516.48■□□□□ 0.236e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-204ENST00000562395 1004 ntTSL 216.43■□□□□ 0.226e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.226e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.37■□□□□ 0.216e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-202ENST00000561725 2738 ntTSL 516.36■□□□□ 0.216e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-216ENST00000480865 1540 ntTSL 516.32■□□□□ 0.26e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.196e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.176e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 216.06■□□□□ 0.166e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.166e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.156e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.136e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.126e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RNF123-208ENST00000469978 889 ntTSL 315.68■□□□□ 0.16e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 GOLGA8B-207ENST00000566258 540 ntTSL 415.57■□□□□ 0.086e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RNF123-205ENST00000444689 442 ntTSL 315.49■□□□□ 0.076e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.065e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.056e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.036e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HOGA1-204ENST00000465608 2581 ntTSL 215.21■□□□□ 0.026e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.026e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.026e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CCDC102A-202ENST00000569068 878 ntTSL 314.9□□□□□ -0.026e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.036e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.046e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.046e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.076e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.076e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-207ENST00000564767 916 ntTSL 214.48□□□□□ -0.096e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 514.46□□□□□ -0.091e-12■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.126e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-12■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.126e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-205ENST00000563301 884 ntTSL 414.28□□□□□ -0.126e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-204ENST00000547125 527 ntTSL 514.06□□□□□ -0.166e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.166e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 513.83□□□□□ -0.26e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.26e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.26e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.216e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-210ENST00000556069 795 ntTSL 213.75□□□□□ -0.215e-16■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.216e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.216e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.216e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.226e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.236e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-212ENST00000523596 559 ntTSL 413.61□□□□□ -0.236e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ATP7B-212ENST00000634519 727 ntTSL 313.6□□□□□ -0.235e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CINP-206ENST00000559504 1781 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.236e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.246e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-218ENST00000568679 539 ntTSL 513.56□□□□□ -0.246e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.256e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-203ENST00000422880 565 ntTSL 413.5□□□□□ -0.256e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.256e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.266e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.276e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.276e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-213ENST00000465181 656 ntTSL 313.3□□□□□ -0.286e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CACNA1E-206ENST00000367573 7067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.36e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CACNA1E-201ENST00000357570 7064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.316e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.316e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.316e-14■■■■■ 335.4
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