Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARD6AQ9NPB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARD6AQ9NPB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms