Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms