Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REEP4Q9H6H4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms