Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIF3L1Q9GZT8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms