Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRCC1Q9C099 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRCC1Q9C099 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms