Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALN1Q9BXU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALN1Q9BXU9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms