Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf78Q9BR46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C20orf78Q9BR46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms