Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RETNLBQ9BQ08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RETNLBQ9BQ08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms