Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP4Q99569 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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