Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC1Q96RQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC1Q96RQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms