Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB3CQ96E17 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms