Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP3Q96DZ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP3Q96DZ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms