Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF653Q96CK0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms