Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4CQ96CF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHMP4CQ96CF2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms