Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCCAG3Q96C92 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.8 ms