Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBASH3BQ8TF42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBASH3BQ8TF42 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms