Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N8P6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N8P6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms