Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms